Некоторые причины сохранения в русском языке старых форм слов с приставкой «не»:

• Образование антонимов. 4 Приставка «не-» служит для выражения противопоставления: «поэты» — «непоэты», «физики» — «нефизики». 4
• Образование слов с противоположным значением. 2 Например, в результате присоединения приставки «не-» к глаголу «навидѣти» («смотреть с удовольствием») появился глагол «ненавидеть» («испытывать к кому-либо сильнейшие отрицательные чувства, неприязнь»). 2
• Сохранение памяти об устаревших словах. 5 Например, от слова «лепый» (означающего «красивый») осталось слово «нелепый» (означающее «бессмысленный, лишённый разумных оснований» и также «нескладный, неуклюжий»). 5
• Изменение значения слов. 25 Например, слово «негодяй» изначально означало «человек, не годящийся к военной службе», а сейчас — «человек, внушающий негодование, совершающий негодные поступки». 2