Слова «дочь» и «доченька» имеют один корень, но разные суффиксы, потому что «доченька» — это уменьшительно-ласкательная форма слова «дочь». 14

Для её образования используется суффикс -еньк-. 14 По правилу, если корень слова оканчивается на мягкий согласный или шипящий, то применяется этот суффикс, если на твёрдый — суффикс -оньк-. 1 В данном случае корень оканчивается на «ч», поэтому используется суффикс -еньк-. 1

Таким образом, разные суффиксы в этих словах указывают на то, что «доченька» — это уменьшительно-ласкательная форма слова «дочь», образованная с помощью определённого суффикса в зависимости от окончания корня. 12