Почему в русском языке некоторые слова имеют корень ЗИМ, а некоторые - КОРН?

Возможно, имелись в виду слова «зима» и «вынуть».

Слово «зима» восходит к основе праиндоевропейского языка, предка большинства языков Европы, славянских и балтийских, а также индоиранских языков (например, санскрита). dzen.ru

Слово «вынуть» — исключение, так как в его формальной структуре нельзя выделить корень. www.techinsider.ru Однако в слове есть однокоренное слово — видовая пара «вынимать» (корень «ним»). www.techinsider.ru Филологи объясняют это так: глагол «вынуть» подвергся процессу переразложения основы и одновременно наложению морфем друг на друга. www.techinsider.ru Это привело к тому, что в формальной структуре слова «вынуть» корень выделить нельзя, но он незримо присутствует в его внутренней форме. www.techinsider.ru

Корень слова — морфема, содержащая лексическое значение слова. www.techinsider.ru Корень — это общая часть всех родственных слов. www.yaklass.ru