Почему в русском языке не всегда совпадает одушевленность существительного с его реальной природой?

Одушевлённость существительного в русском языке не всегда совпадает с его реальной природой, потому что оценка объекта как живого или неживого субъективна. nsportal.ru

Например, растения и грибы в биологии считаются объектами живой природы, но в грамматике эти существительные — неодушевлённые. www.yaklass.ru Некоторые существительные, обозначающие неживые предметы (снеговик, кукла, идол и др.), — грамматически одушевлённые. www.yaklass.ru

Также неоднозначность в оценке объекта как живого или неживого возникает в случаях, когда его принадлежность к животным или растениям может показаться неочевидной (например, амебы, бактерии, вирусы). gramota.ru

Чтобы определить одушевлённость существительного, нужно обратить внимание на грамматические признаки: у одушевлённых существительных во множественном числе совпадают формы винительного и родительного падежа, а у неодушевлённых — формы винительного и именительного падежа. www.yaklass.ru wika.tutoronline.ru