Несколько причин, по которым в русском языке может возникать путаница между буквами «Ю» и «У»:

• Буква «Ю» обозначает два звука. 24 В начале слова, после гласного звука, после Ь и Ъ она обозначает два звука: [й’] и [у]. 3 После согласного звука буква «Ю» обозначает один звук [’у] и мягкость согласного звука. 3
• Буква «У» после шипящих не пишется. 1 Это обусловлено историческими изменениями в фонетике русского языка, когда сочетания шипящих с гласными стали произноситься иначе. 1 Со временем это произношение закрепилось и отразилось в письменности. 1
• Выбор между «У» и «Ю» в окончаниях глаголов зависит от спряжения глагола. 1 В глаголах I спряжения могут встречаться оба варианта: и «У», и «Ю». 1 Выбор зависит от того, стоит ли гласная под ударением или нет. 1