Присутствие урацила в РНК вместо тимина объясняется энергетической выгодностью: для синтеза урацила как неметилированного основания уходит значительно меньше энергии, чем для синтеза метилированного основания — тимина. 1

Также считается, что для РНК это не так критично, как для ДНК, потому что РНК у эукариот не является носителем генетической информации, меньше ДНК и имеет малый срок жизни. 2 Возможно, по этой причине эволюция «не сочла нужным» пока заменять урацил в РНК на тимин. 2

При переходе к «миру ДНК» урацил заменился на тимин по причинам, связанным с надёжностью хранения информации. 4 Специализированный фермент просто удаляет весь урацил из молекулы, восполняя пробелы «правильным» цитозином. 2