Несколько причин, по которым в озёрах с прозрачной водой может обитать не множество видов живых организмов:

• Ослабленная интенсивность света. 3 Это сказывается на развитии фотосинтезирующих растений. 3 Чем меньше прозрачность воды, тем сильнее поглощается свет. 3
• Низкий уровень кислорода. 12 Низкие или бескислородные условия исключают существование многих таксонов, которые физиологически не переносят такие условия. 1
• Эвтрофикация. 1 Увеличение количества питательных веществ приводит к росту фитопланктона, который снижает прозрачность воды и негативно влияет на виды, использующие эту среду для нереста, созревания и общего выживания. 1

Однако стоит отметить, что в каждом водоёме создаются свои индивидуальные условия существования организмов, и в озерах с прозрачной водой могут быть свои особенности, например, в малопитательных (олиготрофных) озерах жизнь развита слабо, но в них часто немало ракообразных — лучшего корма для рыбы. 3