Несколько причин, по которым расщепление по фенотипу может отличаться от ожидаемого 1:1:

• Разная жизнеспособность зигот. 1 Например, гомозиготные формы по доминантным генам иногда оказываются нежизнеспособными, и целый класс расщепления выпадает, давая отношение 2:1 вместо 3:1. 1
• Влияние факторов внешней среды. 1 Например, если подсчитывать расщепление среди семян гороха по окраске — жёлтой или зелёной, то недозрелые семена будут давать промежуточное выражение признака, что затрудняет объективную классификацию. 1
• Малое количество особей в потомстве гибрида. 1 Точное соотношение классов расщепления возможно лишь при большом количестве изучаемых гибридных особей. 5