Разнообразие видов рыб в Онежском озере обусловлено несколькими факторами:

• Неоднородность ихтиофауны. 1 Она состоит из трёх основных групп видов: холодноводных, относительно тепловодных и фоновых. 1
• История формирования. 1 Холодноводные виды появились в позднеледниковье во время существования Южно-Онежского приледникового водоёма. 1 Относительно тепловодные виды проникли в озеро в период голоценового климатического оптимума из Верхне-Волжской водной системы через бассейн Белого озера или через бассейн реки Онеги. 1
• Наличие обильной и разнородной пищи. 4 Разнообразие видов рыб особенно велико в заливах, в которые изливаются значительные реки. 4 Они содержат самую разнородную пищу для рыб и служат временным пристанищем для рыб, идущих на нерест в реки или выходящих из рек в озеро. 4