Почему в некоторых языках существуют различные варианты написания слова «щека»?

Возможно, различные варианты написания слова «щека» в разных языках связаны с этимологией — происхождением слов. etymological.academic.ru ru.wiktionary.org

Есть предположение, что слово «щека» происходит от праформы, предположительно родственной другим словам, например:

• др.-исл. skegg — «борода; окончание носа судна»; ru.wiktionary.org
• skagi м. — «мыс». ru.wiktionary.org

Также существует версия, что в обозначении частей человеческого лица часто происходит перенос по смежности. etymological.academic.ru

Например, в польском языке слово «szczeka» означает «скула, челюсть». etymological.academic.ru ru.wiktionary.org В украинском языке есть слово «щока» со значением «щека». etymological.academic.ru ru.wiktionary.org