Почему в некоторых случаях допускается разделение союза 'после того как' на две части?

Союз «после того как» может разделяться на две части из-за смысла и логического ударения в предложении. nsportal.ru

Первая часть союза в таком случае становится указательным словом и входит в состав главного предложения, а вторая часть остаётся в придаточном предложении и выполняет функцию простого подчинительного союза. nsportal.ru dzen.ru

Некоторые ситуации, когда допускается разделение союза:

• Перед оборотом есть частица «не». vk.com videouroki.net Пример: «Мы договорились встретиться не после того, как начнётся парад, а чуть пораньше». vk.com
• Перед союзом есть вводное слово (например, «пожалуй», «видимо», «вероятно», «к сожалению» и другие). vk.com Пример: «Мы пришли, к сожалению, после того, как всё уже произошло». vk.com
• Есть частицы с ограничительным или усилительным значениями (например, «лишь», «только», «даже» и другие). vk.com Пример: «Только после того, как цены на модемы упали до 30 долларов, производители ПК стали продавать все новые компьютеры в комплекте с модемом». vk.com

Также разделение союза может зависеть от авторского замысла: если говорящий желает придать больший акцент придаточной части, он делает логическое ударение на первую половину союза и разделяет его с помощью интонации. vk.com