Чередование согласных в корнях слов древнерусского происхождения сохраняется из-за фонетических изменений, которые происходили в языке в дописьменный период.                                                                          multiurok.ru                                                                                               nnoc.pskgu.ru                       
 Некоторые из таких изменений:
  - Смягчение твёрдых согласных.                                                                          russianclassicalschool.ru                       Если после твёрдых согласных шёл гласный, который смягчал находящиеся рядом согласные звуки, то и твёрдые согласные старались приспособиться к этому гласному.                                                                          russianclassicalschool.ru                       Например, согласные К, Г, X превращались перед гласными Ь, Ѧ, Ѣ, Е, И в шипящие Ч, Ж, Ш.                                                                          russianclassicalschool.ru                      
- Изменение праславянских дифтонгов.                                                                          vk.com                       Дифтонги (сочетание двух гласных) в положении перед гласной изменялись в сочетание «гласная + j» или «гласная + В», а в положении перед согласной дифтонг изменялся в определённую букву.                                                                          vk.com                      
- Утрата гласными количественных различий.                                                                          vk.com                       Например, чередование К с Ч, Г с Ж, Х с Ш.                                                                          vk.com                      
Исторические чередования возникли в дописьменный период, а с возникновением азбуки закрепились и на письме.                                                                          multiurok.ru                       Как правило, исторические чередования наблюдаются в корнях слов.                                                                          multiurok.ru