Несколько причин, по которым в некоторых популяциях сохраняются гомозиготные аллели:

• Генетический дрейф. 1 Это случайные колебания частоты аллелей гена в ряду поколений популяции с ограниченной численностью. 1 Дрейф, как правило, снижает уровень генетической изменчивости и в малочисленных популяциях приводит к гомозиготности всех особей по одному аллелю. 1 Скорость этого процесса тем больше, чем меньше число особей в популяции. 1
• Миграция. 2 Она может привести к накоплению генов в гомозиготном состоянии, когда мигрируют семьи, группы родственников, кланы. 2

Также в небольших популяциях могут закрепляться аллели с малым адаптивным значением, которые, однако, при изменении среды будут определять приспособленность к новым условиям существования и обеспечивать сохранение вида. 1