Почему в молекулах ДНК используются разные типы фосфодиэфирных связей?

Возможно, имелись в виду фосфодиэфирные связи внутри одной цепи ДНК. Они формируются в результате взаимодействия между 3'-гидроксильной (3'—ОН) группой молекулы дезоксирибозы одного нуклеотида и 5'-фосфатной группой (5'—РО3) другого. ru.wikipedia.org

Обычно в ДНК и РНК такая связь осуществляется только за счёт 3'-ОН группы одного нуклеозидного остатка и 5'-ОН другого, поэтому её называют 3'—5'-фосфодиэфирной. bioclass.ru

Однако в очень редких случаях (как правило, в промежуточных продуктах биосинтеза РНК) для образования дополнительной фосфодиэфирной связи может использоваться 2'-гидроксильная группа нуклеотидных остатков. bioclass.ru