Рекомбинация генов в мейозе происходит благодаря кроссинговеру — процессу, в ходе которого гомологичные хромосомы обмениваются участками. 12
Мейотическая рекомбинация начинается с генетически запрограммированных многочисленных двунитевых разрывов ДНК специфичными для мейоза эндонкулеазами. 3 Большая часть двунитевых разрывов репарируется с сохранением исходной последовательности нуклеотидов, меньшая их часть превращается в обмены между сестринскими хроматидами или между несестринскими (гомологичными) хроматидами. 3
Гомологичная рекомбинация создаёт разнообразие комбинаций генов во время мейоза, обеспечивая высокий уровень наследственной изменчивости, что позволяет популяции лучше адаптироваться в ходе эволюции. 4