Тёмные кольца древесины в центральной части ствола дерева образуются из-за постепенного отмирания более ранних годичных слоёв, находящихся ближе к сердцевине. 4
Одновременно с приростом нового годичного слоя внутри ствола происходит закупорка водопроводящих путей, отложение смолы и углекислого кальция, пропитка дубильными и красящими веществами. 5 В результате цвет отмершей древесины изменяется, она становится более тёмной, чем вся остальная древесина. 45
Отмершую древесину внутри ствола принято называть ядром, а породы, в которых оно образуется, — ядровыми. 4 Слой живой древесины, расположенный вокруг ядра, называют заболонью. 4
Также тёмные пятна на древесине берёзы, рябины, клёна и ольхи могут быть заросшими ходами насекомых. 4