Некоторые причины, по которым в аквариуме сложнее поддерживать экологический баланс, чем в природном водоёме:

• Закрытость системы. 4 Аквариум — закрытая система, окружающая среда состоит исключительно из аквариума и его содержимого. 4 Естественные процессы, которые в дикой природе обеспечивали бы рыбам пищу, защиту и чистую среду обитания, не являются частью аквариума. 4
• Несоответствие объёма аквариума количеству обитателей. 2 Теснота приводит к недостатку кислорода и перенасыщению системы отходами жизнедеятельности рыб. 2 Микроорганизмы перестают справляться с их переработкой, и даже мощный фильтр не помогает. 2
• Частая замена воды. 2 Изъятие большой массы воды не позволяет сформироваться экосистеме: вместе с водой удаляется значительная часть микроорганизмов, отвечающих за протекание естественных процессов в аквариуме. 2 К тому же резкое изменение химического состава среды негативно сказывается на обитателях водоёма. 2
• Использование плохо обработанных или некачественных украшений. 2 Коряги и укрытия из кокосовой скорлупы без должной обработки могут создать ряд проблем: помутнение воды, изменение кислотно-щелочного баланса, выделение дубильных веществ. 2

С другой стороны, аквариумом проще управлять и лечить: многие параметры можно легко регулировать — освещение, кислород, состав воды и многое другое. 5