Несколько причин, по которым в агроэкосистемах часто происходит накопление органических веществ:

• Упрощённая композиция. 4 Видовое разнообразие в таких экосистемах сведено к минимуму, доминирует чаще один, реже несколько видов культурных растений. 4 Это уменьшает количество пищевых связей и делает их разомкнутыми и укороченными в сравнении с природными. 4 В связи с этим круговорот веществ осуществляется не в полном объёме, как в природе. 4
• Применение органических удобрений. 5 Создание повышенного органического фона способствует активизации биологических процессов в почве, что улучшает обеспеченность растений питательными веществами и биологически активными соединениями, а также фитосанитарное состояние почв. 5
• Массовая гибель микроорганизмов. 2 После неё в почве накапливается значительное количество микробной биомассы, которая подлежит минерализации. 2 Вместе с ней в почву поступают питательные вещества, включенные в микробные клетки. 2