Углерод-13 используется в масс-спектрометрии для обнаружения аминокислот, потому что при использовании в качестве источников стабильных изотопов (13С)метанола и 2Н2О в клетке синтезируются изотопнозамещённые аминокислоты, различающиеся количеством атомов, замещённых на 13С и 2Н. 12

При этом чем выше молекулярная масса аминокислот, тем возможен больший набор ионов, соответствующих изотопнозамещённым формам. 2 Это позволяет идентифицировать 13С-аминокислоты в присутствии низкомолекулярных метаболитов среды и других продуктов аминирования и карбоксиметилирования аминокислот. 1

Также предпочтительное применение стабильных изотопов по сравнению с их радиоактивными аналогами обусловлено отсутствием радиационной опасности и возможностью определения локализации метки в молекуле методами высокого разрешения, включая масс-спектрометрию. 2