У японских бобтейлов раздвоенный хвост из-за генетической мутации. 13 Короткий и изогнутый хвост у этих кошек вызван экспрессией доминантного гена. 1

Ген бобтейла вызывает уменьшение количества хвостовых позвонков, а также некоторое сращивание хвостовых позвонков. 1 Этот тип хвоста уникален не только для данной породы, но и для каждой отдельной кошки, нет двух абсолютно одинаковых. 1

Ген, отвечающий за форму хвоста, у японских бобтейлов рецессивный, поэтому при скрещивании с длиннохвостым партнёром короткохвостых котят в первом поколении не получится. 4

Согласно стандарту породы, хвост должен иметь перегибы, изгибы, углы или некоторую комбинацию этих элементов. 2