У некоторых пещерных рыб нет боковой линии, потому что в условиях пещерных потоков её работа оказывается не так эффективна, как вне пещеры. 1 Например, у вида Astroblepus pholeter функции боковой линии взяли на себя небольшие выступы на поверхности тела — кожные зубы. 1 Они выступают сквозь кожу на некоторое расстояние и позволяют ощущать движения воды вокруг тела животного. 1

Также есть мнение, что для ориентации в пространстве у пещерных рыб достаточно тактильных стимулов, и система боковых линий не является необходимой. 4 Например, у вида Astyanax fasciatus при нарушении боковой линии рыбы всё равно ориентируются по течению и чаще плывут вверх по течению с более высокой скоростью. 4

Таким образом, отсутствие боковой линии у некоторых пещерных рыб может быть адаптацией к условиям обитания, когда её работа в определённых условиях оказывается менее эффективной.