Отклонения от нормы в фотопериодизме у растений могут происходить по разным причинам, среди них:

• Климатические факторы. 1 Например, в тропических районах длина дня меняется незначительно, поэтому растения, происходящие оттуда, наиболее чувствительны к изменениям длины дня. 1 Растения умеренных широт оценивают длину дня менее точно, но она играет важную регуляторную роль в развитии. 1
• Особенности освещения, температурного и влажностного режима. 3 На фотопериодичность растений могут влиять, в частности, особенности освещения и введение минеральных удобрений. 3
• Жизненная фаза растения. 2 Для большинства растений характерна ювенильная фаза, то есть фаза юности. 2 Цветение невозможно до тех пор, пока организм не достигнет определённой стадии зрелости. 2
• Необходимость в других стимулах окружающей среды. 2 Иногда реакция на фотопериод срабатывает только в сочетании с другими стимулами. 2 Наиболее распространённый стимул — температура. 2 Например, двулетние растения, такие как белена чёрная, не будут цвести в первый год жизни, несмотря на подходящий фотопериод, потому что нуждаются в длительном воздействии низких температур. 2
• Генетические факторы. 5 Мутации в генах могут влиять на фотопериодическую чувствительность растений. 5 Например, мутации в кодирующей последовательности Ppd-H1 объясняют изменения во времени развития цветков у ячменя, а мутации в регуляторных областях гена Ppd-D1 способствуют изменению фотопериодической чувствительности у пшеницы. 5