У бордер-колли часто встречается гетерохромия глаз из-за гена merle, который отвечает за неравномерное распределение окраса. 1
Также гетерохромия может появляться в результате близкородственного скрещивания или недостатка пигмента меланина, окрашивающего радужку — это врождённое разноглазие. 2