У архей и эукариот гистоны связаны с ДНК, чтобы поддерживать структуру хромосом и контролировать активность генов. 14

Гистоны формируют нуклеосому — белковую глобулу, вокруг которой накручена нить ДНК. 2 Контакт между гистонами и ДНК достаточно прочный: в каждой нуклеосоме образуется 142 водородные связи. 2

У бактерий, по некоторым предположениям, гистоны нужны для защиты ДНК от нежелательной интеграции чужих геномных фрагментов. 5

При этом у бактерий и архей структура взаимодействия ДНК и гистонов отличается: у архей образуются маленькие нуклеосомы из четырёх белковых молекул, которые служат для компактной укладки ДНК. 3 У бактерий, например у Bdellovibrio bacteriovorus, гистоны объединяются в пары, которые окружают нить ДНК и действуют как щит вокруг неё. 1