Теория «рептильного мозга» (также известная как теория «триединого мозга» Пола Маклина) считается псевдонаучной по нескольким причинам: 12

• Неверное понимание развития жизни на Земле. 1 Эволюция происходила не линейно, а через разветвление. 1 Один общий предок мог породить несколько видов, мозг которых развивался по разным сценариям. 1 Млекопитающие и рептилии имеют общие корни, но предполагается, что их пути разошлись около 320 миллионов лет назад, поэтому млекопитающие не могли стать наследниками «рептильной системы мозга». 1
• Отсутствие чёткого разделения на «древние» и «новые» структуры. 1 Нейроны, унаследованные от общего предка, распределены по разным областям мозга как у рептилий, так и у млекопитающих, а не сконцентрированы в какой-либо определённой «рептильной зоне». 1
• Отсутствие доказательств того, что неокортекс и рептильный мозг развивались в разное время. 1 Сигналы в головном мозге не передаются снизу вверх — мозг функционирует как целостная система, где одни и те же области участвуют в различных процессах. 1

Официальная наука считает теорию «рептильного мозга» лишённой основания — никакой древней и примитивной части, отвечающей за базовое поведение, в голове попросту нет. 1