Температура в атмосфере Юпитера увеличивается с глубиной из-за внутреннего нагрева планеты. 34 Юпитер излучает гораздо больше тепла, чем получает от Солнца. 34 Избыток тепла, скорее всего, является следствием нагрева на ранних стадиях формирования Юпитера. 34

Также на температуру атмосферы влияют процессы внутренней конвекции, которые напоминают «термостат», высвобождая вблизи от полюсов больше тепла, чем на экваторе. 34 Это приводит к равномерному распределению температуры в тропосфере. 34

Кроме того, по наблюдениям, полярные сияния на полюсах Юпитера разогревают атмосферу планеты на большую глубину, чем считалось ранее, — это бурная реакция на солнечный ветер. 2