Изучение структурных и функциональных характеристик мембранных белков сложно по нескольким причинам:

• Прочная связь с липидным бислоем. 4 Мембранные белки, как правило, нерастворимы в воде и прочно связаны с липидным бислоем. 4 Для их очистки и солюбилизации приходится применять детергенты или другие вещества, разрушающие мембрану. 4
• Разнообразие структур. 1 Мембранные белки построены в различных складках и архитектурах, они по-разному и динамично взаимодействуют с гетерогенными мембранными липидами. 1
• Малый размер некоторых структур. 2 Например, функциональные неоднородности (рафты) сложно наблюдать «напрямую» из-за их малого размера. 2
• Необходимость реконструкции. 4 Функциональную активность некоторых мембранных белков, таких как ионные каналы или транспортные белки, можно охарактеризовать и измерить только в реконструированных мембранных системах. 4

Несмотря на сложности, область биологии мембранных белков продолжает развиваться, и за последние два десятилетия достигнут значительный прогресс в изучении их структуры. 1