Сверхдоминирование выгодно для популяций, потому что оно способствует поддержанию сбалансированного генетического полиморфизма. 4 То есть в течение многих поколений в определённых соотношениях сосуществуют все возможные генотипы. 4

Например, повышенная частота аллеля гена серповидноклеточной анемии в популяциях человека, живущих в условиях высокой вероятности заражения малярией, обусловлена тем, что гетерозиготы по этому гену не болеют серповидноклеточной анемией и устойчивы к малярии. 14

Однако сверхдоминирование связано с генетическим грузом: более приспособленные гетерозиготные организмы при скрещивании как между собой, так и с представителями других генетических классов должны давать менее приспособленное потомство. 12