Почему существует разница во времени полета по экватору и по параллелям?

Возможно, имелась в виду разница во времени полёта в разных направлениях, в том числе вдоль экватора и по параллелям. На продолжительность полёта влияют, например, такие факторы:

• Вращение Земли. physics.stackexchange.com dzen.ru Различные области планеты вращаются с разной скоростью: по мере удаления от экватора к полюсам скорость вращения уменьшается. dzen.ru Как правило, вдоль экватора скорость вращения выше. dzen.ru
• Воздушные потоки. dzen.ru На время полёта влияют реактивные потоки — воздушные потоки большой высоты, которые генерируются вращением Земли вместе с нагреванием атмосферного воздуха. dzen.ru Как правило, это западные ветры. physics.stackexchange.com dzen.ru
• Часовые пояса. www.bolshoyvopros.ru При полёте с запада на восток самолёт переходит в часовые пояса, где местное время имеет большее значение. www.bolshoyvopros.ru При полёте с востока на запад самолёт летит в пояса, где местное время имеет меньшее значение. www.bolshoyvopros.ru

Таким образом, на время полёта влияют как особенности вращения Земли, так и атмосферные явления.