Субстратное фосфорилирование важно для работы мышц в условиях недостатка кислорода, потому что служит для быстрой регенерации АТФ независимо от доступности акцепторов электронов для дыхательной цепи переноса, то есть в отсутствии кислорода. 1

Кроме того, субстратное фосфорилирование способствует более полному использованию энергии окисляемых веществ, так как без него часть энергии просто бы терялась, превращаясь в теплоту. 1

Также субстратное фосфорилирование является единственным способом энергообеспечения кратковременных максимальных мышечных усилий, так как этот механизм позволяет быстро воспроизводить АТФ. 4