Субстратное фосфорилирование важно для выживания клеток в условиях недостатка кислорода, потому что служит для быстрой регенерации АТФ независимо от доступности акцепторов электронов для дыхательной цепи переноса, то есть в отсутствии кислорода. 12

Некоторые примеры важности субстратного фосфорилирования:

• Эритроциты человека. 12 В них полностью отсутствует аэробное дыхание, и вся энергия генерируется исключительно за счёт субстратного фосфорилирования гликолиза. 12
• Мышцы. 12 При недостатке кислорода они получают энергию именно по этому пути или за счёт креатинфосфата. 12

Кроме того, субстратное фосфорилирование способствует более полному использованию энергии окисляемых веществ, так как без него часть энергии просто бы терялась, превращаясь в теплоту. 12