Субстратное фосфорилирование считается менее эффективным способом синтеза АТФ, чем окислительное фосфорилирование, потому что при субстратном фосфорилировании образуется меньше АТФ, чем при окислительном. 3

Окислительное фосфорилирование протекает в митохондриях и является основным путём образования АТФ. 2 АТФ синтезируется за счёт энергии переноса электронов и протонов по цепи переносчиков. 1 От одной молекулы глюкозы при окислительном фосфорилировании образуется, например, 32 АТФ. 3

Субстратное фосфорилирование имеет второстепенное значение, не сопряжено с окислительным распадом веществ, протекает в основном в цитоплазме. 2 При субстратном фосфорилировании от одной молекулы глюкозы образуется только 2 АТФ. 3