Стоп-кодоны важны для синтеза белков у прокариотов и эукариотов, потому что они указывают на окончание процесса. 34

Когда в активном центре рибосомы оказывается стоп-кодон (УАА, УАГ или УГА), синтез полипептидной цепи заканчивается. 1 Молекула белка отсоединяется от рибосомы, выходит в цитоплазму и усложняется, образуя характерную вторичную, третичную и четвертичную структуры. 1

Из-за отсутствия тРНК, соответствующих стоп-кодонам, пептидил-тРНК остаётся связанной с Р-сайтом рибосомы. 3 Здесь в действие вступают специфические белки RF1 или RF2, которые катализируют отсоединение полипептидной цепи от мРНК, а также RF3, который вызывает диссоциацию мРНК из рибосомы. 3