Ранее шимпанзе относили к семейству понгид (Pongidae) из-за физических характеристик, которые объединяли человекообразных обезьян в отдельную группу. 3
Однако генетический анализ показал, что шимпанзе и другие представители семейства понгид (орангутаны, гориллы) более тесно связаны с людьми, чем с орангутангами. 3 Это привело к тому, что семейство понгид стало парафилетическим, то есть включало не все виды, произошедшие от их ближайшего общего предка. 24
В современной биологии стремятся к монофилетическим таксонам, поэтому большинство биологов включают орангутанов в семейство гоминид в качестве подсемейства понгины (Ponginae), а горилл и шимпанзе часто включают в подсемейство гоминины (Homininae) вместе с людьми. 24