Современные методы генетического анализа нельзя считать полностью автоматизированными по нескольким причинам:

• Некоторые процессы требуют ручной работы, например, установление модели наследования. 1 Для этого необходимо высказывать предположения, а затем тестировать выбранную модель по фенотипам потомков. 1
• Некоторые методы не подходят для тестирования в малых объёмах. 3 Например, анализ микрочипов для генотипирования не подходит для малых объёмов, так как оборудование и отдельные матрицы могут быть дорогостоящими. 3

Однако в целом современные генетические анализаторы практически полностью автоматизированы благодаря разработкам в области инженерии, робототехники и нанотехнологий. 5 Человек в таких приборах выступает больше как оператор и наблюдатель. 5 Например, высокотехнологичные приборы позволяют обрабатывать большое количество образцов для ДНК-анализа за считанные часы и не требуют скрупулёзной ручной работы генетика. 5