Некоторые причины, по которым современная фауна кайнозоя отличается от меловой:

• Вымирание многих групп животных и растений в конце мелового периода. 24 Вымерли динозавры на суше и крупные плавающие рептилии в морской среде, большая часть микроскопического планктона. 2
• Возникновение свободных экологических ниш после вымирания. 24 В кайнозое наблюдалась быстрая диверсификация форм жизни в этих нишах. 2
• Доминирование покрытосеменных растений в кайнозое. 5 Разнообразие цветков и плодов покрытосеменных обусловило большое разнообразие насекомых, которые их опыляют и употребляют в пищу. 5
• Появление новых групп млекопитающих. 5 Началась специализация млекопитающих по разным экологическим нишам. 5 Появились предки копытных, хищных, грызунов, приматов и хоботных. 5
• Изменение фауны морей и океанов. 5 В воде в кайнозое доминируют костные рыбы, некоторые млекопитающие осваивают водную среду, появляются китообразные и ластоногие. 5
• Развитие брюхоногих моллюсков. 5 Они хорошо приспособились и к суше, и к пресным и солёным водоёмам. 5 Головоногие и створчатые моллюски переживают некоторый спад. 5