Соматические мутации не проявляются у индивидуума сразу по нескольким причинам:

• Мутации могут содержаться не во всех клетках организма. 1 Нормальные и мутантные клетки сосуществуют у одного индивидуума, что приводит к мозаицизму — наличию в организме клеток, отличающихся по своему генотипу и его фенотипическим проявлениям от других клеток этого же организма. 1
• Некоторые изменения ДНК не имеют фенотипических эффектов. 5 Например, хромосомная транслокация или инверсия может не влиять на критическую часть генома и не иметь последствий. 5
• Организмы способны защищать свой генотип от действия мутагенных факторов. 2 Если в клетке при репликации ДНК возникает мутация, специальные ферменты опознают мутантный участок ДНК и вырезают его. 2 Затем другие ферменты достраивают фрагмент ДНК без «ошибок» и встраивают «правильный» фрагмент на место удалённого мутантного участка. 2
• Парность хромосом в диплоидном кариотипе соматических клеток эукариот. 3 Парность аллелей генов препятствует фенотипическому проявлению мутаций, если они имеют рецессивный характер. 3