Система классификации Линнея считается искусственной, потому что она основывается на внешних признаках организмов, которые не всегда отражают их родственные отношения. 3
Линнейская система основана на делении организмов на группы по определённым характеристикам, таким как форма листа или наличие цветка. 3 В результате такого подхода близкие по генетике организмы могут попасть в разные группы, а далёкие по генетическому родству — в одну. 3
Кроме того, система Линнея не предусматривает учёт эволюции. 3 Она была создана в эпоху, когда обобщение о сложных механизмах эволюции было отсутствующим, поэтому не отображает изменения, которые произошли в организмах на протяжении миллионов лет. 3
Например, подсчитывая число тычинок у моркови и льна, Линней поместил их в одну группу на том основании, что у них по пять тычинок в цветке. 4 На самом деле эти растения принадлежат к разным родам и семействам. 4