Синий марлин считается уязвимым видом из-за перелова. 14

Основную опасность для вида представляет ярусный лов, при котором используются крючки с наживкой, прикреплённые к крючковому орудию лова — пелагическому или донному ярусу. 5 Японские и кубинские рыбаки ежегодно добывают тысячи тонн марлина только в Карибском регионе. 1

Несмотря на то, что в США принят закон, обязывающий все суда в пределах 370 км от береговой линии выпускать всех пойманных марлинов, выживаемость выпущенных рыб низкая из-за увечий, нанесённых при поимке. 1

Вследствие перелова Международный союз охраны природы присвоил этому виду статус «Уязвимый». 1