Сильные магнитные бури опасны для авиаперелётов, потому что могут привести к сбоям в работе навигационных систем и радиосвязи. 14

Геомагнитные возмущения влияют на точность определения местонахождения самолётов с помощью систем ГЛОНАСС и GPS. 4 Это происходит из-за рассеивания сигнала в ионосфере на высоте 300–400 километров. 4 Когда возникает турбулентность, сигнал толстеет, и точность позиционирования может чередоваться до 100 метров. 4 В такой ситуации посадка авиалайнеров в сложных погодных условиях может оказаться невозможной. 4

Также во время магнитных бурь может ненадолго пропасть радиосвязь с самолётом. 1

Чтобы снизить риски, по команде диспетчера воздушные суда могут менять маршрут, что удлиняет полёт и увеличивает расход топлива. 1