Щитовник мужской считался редким видом в некоторых регионах России, несмотря на широкое и почти повсеместное распространение, из-за сокращения популяции. 12 Это связано с уязвимостью уже образовавшихся сообществ растений, которые плохо переносят вырубку лесов и любое вторжение человека в свою среду. 1

Также у щитовника мужского чувствительные корневища, которые легко повреждаются, но очень трудно восстанавливаются. 1

Например, в Ростовской области к лимитирующим факторам, влияющим на численность вида, относят узкую экологическую амплитуду на границе ареала, относительную малочисленность и изолированность популяций, антропогенные изменения среды обитания (выпас и рубки в лесах, лесные пожары). 5