Сцепленное наследование не всегда соответствует правилу Менделя, потому что гены, находящиеся в одной хромосоме, образуют группу сцепления и наследуются совместно. 2 Это нарушает третий закон Менделя о независимом наследовании признаков. 2 В результате ожидаемое расщепление признаков не соответствует менделевским законам, и некоторые комбинации признаков проявляются чаще других. 2

Однако сцепленное наследование может нарушаться из-за кроссинговера. 3 Это процесс обмена участками между гомологичными хромосомами во время мейоза. 2 В результате кроссинговера происходит рекомбинация генетического материала, что приводит к нарушению сцепления между генами. 2 Гены, ранее находившиеся на одной хромосоме, могут перейти на разные, и сочетания признаков у потомства становятся более разнообразными. 2