Самоопыление считается менее эффективным способом размножения по сравнению с перекрёстным опылением, потому что при нём не достигается того генетического разнообразия, которое возможно при перекрёстном опылении. 1

При самоопылении пыльца переносится на рыльце пестика своего же цветка, в то время как при перекрёстном опылении пыльца переносится на рыльце другого цветка. 14 В результате дочернее растение получает признаки от двух родителей, в то время как при самоопылении оно является копией родительского растения. 12

Кроме того, при самоопылении дефектные гены и мутации, если они есть, передаются от поколения к поколению. 2