Протонефридий считается продвинутой структурой выделения у плоских червей, потому что это первый специализированный орган выделения, в то время как у простейших и кишечнополостных выделение происходило всей поверхностью тела. 2

Некоторые особенности протонефридия:

• Система канальцев. 1 Протонефридии представляют собой систему канальцев, которые начинаются от пламенных (мерцательных или звёздчатых) клеток и заканчиваются порами на теле. 1
• Непрерывный ток жидкости. 2 Реснички пламенных клеток своим постоянным движением обеспечивают постоянный ток жидкости с продуктами метаболизма. 1
• Разнообразие функций. 3 У пресноводных плоских червей протонефридии служат, в основном, для осморегуляции. 3 У некоторых паразитических плоских червей главная функция протонефридиев заключается в избавлении от конечных продуктов азотистого обмена. 3