Простейших относят к царству протистов, а не к животным, из-за сложности проведения чёткой границы между некоторыми простейшими и животными. 14

Некоторые простейшие могут использовать как автотрофный (фотосинтез), так и гетеротрофный (потреблять готовые органические вещества) типы питания. 4 Кроме того, есть организмы, которые часть своей жизни проводят как типичные животные, а другую часть — как настоящие растения. 1

Также учёные считают, что протисты являются переходными в эволюционном плане организмами от прокариот к другим царствам эукариот (растениям, животным и грибам). 13

Таким образом, выделение простейших в отдельное царство протистов связано с тем, что при классификации этих организмов возникли сложности, связанные с их особенностями и сложностью разграничения с другими группами живых существ.