Происхождение пластид имеет важное значение для понимания эволюции растений, потому что исследование сложных эволюционных путей пластид помогает проследить стадии перестроения систем наследования, транспорта веществ, биохимических путей хозяина и симбионта. 45

Считается, что пластиды возникли в результате симбиоза фототрофных прокариот — цианобактерий — с более крупными первичными эукариотическими клетками более 1 млрд лет назад. 2 В дальнейшем этот симбиотический процесс происходил неоднократно (как минимум трижды). 2

Анализ ДНК и морфологии пластид у разных организмов показывает, что эукариоты приобретали пластиды в несколько этапов и часто независимо друг от друга. 45