Принцип свободы научного творчества считается идеальным, но труднореализуемым в науке по нескольким причинам:

• Противоречие между свободой и ответственностью. 2 Свобода научного творчества связана с научным риском, за который учёный несёт ответственность. 2 При этом ответственность немыслима без свободы, а свобода без ответственности становится произволом. 2
• Необходимость учёта этических, социальных и материальных факторов. 1 Например, в некоторых сферах науки (биомедицина, взаимодействие человека и компьютерных систем, искусственный интеллект и другие) на первоначальном этапе формирования идеи требуется подтверждение соответствия выработанной аксиологии. 5
• Сложности обеспечения запретов. 5 Они могут быть неточными и быстро устаревать из-за ускоренного развития научных достижений. 5 Кроме того, из-за международного характера научной деятельности запреты в одной стране могут быть минимизированы или устранены в другой. 5
• Сложности в ранжировании и классификации ценностей. 5 Этот процесс требует заметных усилий, анализа и учёта значительного числа факторов, что может отвлечь исследователя от решения непосредственных задач разработки. 5

Таким образом, свобода научного творчества рассматривается не как абсолютное право, а как соглашение между учёным и обществом, условия которого могут меняться в зависимости от ситуации. 2