При составлении генетических карт используются маркеры фенотипических признаков, потому что они позволяют локализовать и идентифицировать локусы количественных и/или качественных признаков, а также устанавливать эффекты действия или взаимодействия локусов этих признаков. 1
Это необходимо, так как из-за различий воздействия окружающей среды один и тот же генотип может проявлять различные фенотипы. 1 В такой ситуации нужны специальные метки, которые помогают различать генотипы между собой, даже если они имеют схожий фенотип, и наоборот. 1
Кроме того, использование значительного числа маркеров, ассоциированных с исследуемыми признаками и нанесённых на генетические карты, гарантирует лучшее покрытие генома изучаемого генотипа и, как следствие, позволяет более точно определять и использовать генетическое разнообразие изучаемых образцов. 4