Окрас невской маскарадной кошки возникает при скрещивании сибирской и сиамской пород из-за мутации гена, отвечающего за колор-пойнт. 1

Также на окрас влияет особый ген с термической чувствительностью. 2 Он не даёт пигменту проникать в структуру волосинок при высоких температурах, поэтому только самые холодные участки, подверженные наиболее низким температурам, имеют тёмный окрас: морда, лапы, хвост и кончики ушей. 2

Кроме того, голубые глаза у невских маскарадных кошек появились благодаря гену сиамского окраса, который привнёс его из различных пород кошек, несущих этот ген. 4

Как и у других колорпойнтовых кошек, невская маскарадная при рождении почти белая, а с возрастом окрас становится более тёмным. 3