При скрещивании организмов, имеющих разные пары аллельных генов, новые комбинации признаков возникают благодаря закону независимого наследования признаков. 13 Согласно ему, разные пары признаков, определяемые неаллельными генами, передаются потомкам независимо друг от друга и комбинируются у них во всех возможных сочетаниях. 1

Также новые комбинации признаков могут появляться в результате процесса кроссинговера. 1 При нём гомологи сближаются своими аллельными генами, а затем обмениваются соответствующими участками. 1 В результате появляются кроссоверные хромосомы с новым набором аллелей. 1

Ещё один фактор, который способствует возникновению новых комбинаций признаков, — комплементарность. 13 Это тип взаимодействия неаллельных генов, при котором один доминантный ген дополняет действие другого, и они вместе определяют новый признак, который отсутствует у родителей. 1